Semestre 3
97,5 heures
Prérequis
Disciplinaires
Organisation et diversité du vivant
Composition, caractéristiques et propriétés des molécules du vivant
Organisation et fonctionnement cellulaire
Notions sur la diversité des besoins nutritifs et des métabolismes
Connaissances mathématiques
Connaissances théoriques de méthodes d’exploration en biologie
Bonnes pratiques en laboratoires (Obligatoire. Une formation est prévue pour les néo-entrants)
Transversaux
Capacité d'observation
Maitrise du langage scientifique, utilisation de l'argumentation et de la logique
Capacité à travailler avec méthodologie et en autonomie
Compétences visées
Générique en L2
Comprendre et savoir restituer les mécanismes et réactions sous-tendant les fonctions du vivant.
Disciplinaire
Maitriser les étapes de la transmission de l’information génétique, de l’ADN jusqu’à la protéine
Décrire et hiérarchiser la structure d’une protéine
Mettre en relation le devenir d’une protéine avec son environnement chimique et physique
Analyser les réactions biochimiques individuelles, couplées et successives : évaluer leur réversibilité et spontanéité, calculer la variation d’énergie libre
Décrire le rôle central des composés phosphorylés dans les processus métaboliques
Définir et illustrer la notion d’homéostasie
Présenter le fonctionnement de voies métaboliques et de la physiologie de la nutrition animale et végétale
Être capable de développer une approche comparative des processus selon les organismes
Identifier et mettre en œuvre des techniques de base appropriées à l’analyse du vivant, selon des bonnes pratiques de laboratoire
Être capable d’utiliser et d’établir un modèle mathématique à partir de données expérimentales, en pouvant recourir à des logiciels dédiés
Transversales
Analyser et synthétiser des informations et données scientifiques en étant sensibilisé à la manipulation de données
Être capable d’échanger avec ses pairs sur les notes et exercices de cours
Rédiger des rapports en français.
Enjeux du cours
Présenter les grands principes des flux d’information, de matière et d’énergie dans le vivant, ainsi que les approches expérimentales et de modélisation permettant de les étudier
Programme du cours
UE De l’expression des gènes à la structure des protéines (19,5h CM – 15h TD)
Etapes de la transcription et de la traduction chez les Bactéries et les Eucaryotes
Les structures et propriétés des protéines
Influence des propriétés de l’environnement sur la structure des protéines
Méthodes d’analyse en biochimie des protéine
UE Nutrition et Bioénergétique (16,5h CM – 13,5h TD)
Réactions biochimiques : équilibres chimiques, réversibilité, spontanéité
Les principes de la thermodynamique appliqués aux réactions biochimiques (conditions standards, variation d’énergie libre, couplage énergétique)
Rôle des composés phosphorylés et des flux d’électrons dans les processus métaboliques
Maintien de l’homéostasie
Circulation : sang et sève
Nutrition à l’échelle de l’organisme (animal et végétal)
Réserves métaboliques
UE Bio-modélisation et Méthodes expérimentales (3 h CM – 12h TD – 18h TP)
Approches expérimentales en biologie, biochimie et physiologie
Introduction à la modélisation en Biologie
Applications aux modèles de croissance en écologie
Travaux pratiques en laboratoire
Biologie moléculaire : extraction, purification et dosage des acides nucléiques, micropipetage
Biochimie : chromatographie, électrophorèse, préparation de tampon
Histologie : observation de la cellule, matrice extracellulaire, tissus, organes ; réaliser des dessins d'observation, choix de l'outil (microscope, loupe)
